法院会冻结配偶账户吗

有可能会，有可能不会。一般情况下，法院冻结的依据是债权人的申请。债权人申请时必须向法院指明是哪个银行，不一定指明银行账号。如果债权人向法院提出申请，法院就冻结;如果债权人没有申请，法院就不会冻结。如果债权人不知道夫妻在哪个银行有存款，就无法申请，法院就不会冻结。
《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第一条
《中华人民共和国民事诉讼法》第二百三十六条
《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十二条