厂里扣员工工资合法吗

不合法。根据相关的《劳动法》规定，公司是不能克扣员工的工资，也就是说，工资应该按照规定的时期，以货币支付给劳动者本人，不能克扣或是无故的拖欠员工的工资。
《劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。