员工罚款要算个税吗

需要结合具体情况分析。员工违反公司规章制度的处罚是否属于扣减工资性质，应由公司按其工资薪酬制度确定。如果属于扣减工资性质而被扣款，该扣款在计算应发工资总额时已扣除，则这部分扣款不再计算个人所得税。
法律依据：《工资支付暂行规定》第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。